Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms