Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGIP1Q9BQI5 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms