Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms