Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CICQ96RK0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CICQ96RK0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CICQ96RK0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CICQ96RK0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CICQ96RK0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CICQ96RK0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CICQ96RK0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CICQ96RK0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CICQ96RK0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CICQ96RK0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CICQ96RK0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms