Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms