Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX1

C4orf36, Uncharacterized protein C4orf36, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf36Q96KX1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms