Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIC2Q96JB3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms