Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms