Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms