Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms