Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms