Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms