Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms