Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FAT3Q8TDW7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms