Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms