Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APCDD1LQ8NCL9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms