Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms