Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms