Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTBP4Q8N2S1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LTBP4Q8N2S1 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LTBP4Q8N2S1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTBP4Q8N2S1 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTBP4Q8N2S1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTBP4Q8N2S1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTBP4Q8N2S1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTBP4Q8N2S1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTBP4Q8N2S1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTBP4Q8N2S1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP4Q8N2S1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP4Q8N2S1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP4Q8N2S1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP4Q8N2S1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP4Q8N2S1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP4Q8N2S1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP4Q8N2S1 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP4Q8N2S1 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP4Q8N2S1 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP4Q8N2S1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP4Q8N2S1 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP4Q8N2S1 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP4Q8N2S1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP4Q8N2S1 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP4Q8N2S1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP4Q8N2S1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP4Q8N2S1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms