Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms