Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRAPPC6BQ86SZ2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRAPPC6BQ86SZ2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRAPPC6BQ86SZ2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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