Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms