Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms