Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms