Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms