Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
WSCD1Q658N2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms