Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms