Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms