Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms