Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms