Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 IYD-208ENST00000500320 2158 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms