Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms