Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms