Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms