Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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