Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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