Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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