Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms