Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms