Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
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