Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB2AQ13885 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB2AQ13885 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB2AQ13885 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB2AQ13885 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB2AQ13885 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB2AQ13885 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB2AQ13885 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB2AQ13885 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB2AQ13885 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB2AQ13885 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB2AQ13885 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB2AQ13885 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB2AQ13885 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB2AQ13885 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB2AQ13885 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB2AQ13885 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB2AQ13885 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TUBB2AQ13885 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TUBB2AQ13885 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TUBB2AQ13885 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TUBB2AQ13885 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2AQ13885 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms