Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
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SHROOM2Q13796 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
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SHROOM2Q13796 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
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SHROOM2Q13796 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
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SHROOM2Q13796 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
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SHROOM2Q13796 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
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SHROOM2Q13796 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
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