Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
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