Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC1Q13547 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC1Q13547 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC1Q13547 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC1Q13547 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC1Q13547 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC1Q13547 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC1Q13547 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC1Q13547 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HDAC1Q13547 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC1Q13547 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC1Q13547 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC1Q13547 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC1Q13547 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC1Q13547 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC1Q13547 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC1Q13547 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC1Q13547 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC1Q13547 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC1Q13547 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC1Q13547 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC1Q13547 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HDAC1Q13547 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC1Q13547 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC1Q13547 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC1Q13547 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC1Q13547 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC1Q13547 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC1Q13547 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC1Q13547 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC1Q13547 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC1Q13547 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC1Q13547 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC1Q13547 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC1Q13547 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC1Q13547 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HDAC1Q13547 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC1Q13547 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC1Q13547 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC1Q13547 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HDAC1Q13547 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC1Q13547 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC1Q13547 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HDAC1Q13547 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HDAC1Q13547 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HDAC1Q13547 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HDAC1Q13547 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC1Q13547 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC1Q13547 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HDAC1Q13547 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC1Q13547 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC1Q13547 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HDAC1Q13547 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC1Q13547 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC1Q13547 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC1Q13547 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC1Q13547 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC1Q13547 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC1Q13547 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HDAC1Q13547 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC1Q13547 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC1Q13547 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC1Q13547 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC1Q13547 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC1Q13547 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC1Q13547 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC1Q13547 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC1Q13547 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC1Q13547 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC1Q13547 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC1Q13547 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC1Q13547 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HDAC1Q13547 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC1Q13547 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC1Q13547 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC1Q13547 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC1Q13547 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC1Q13547 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC1Q13547 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC1Q13547 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC1Q13547 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC1Q13547 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC1Q13547 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC1Q13547 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC1Q13547 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC1Q13547 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC1Q13547 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC1Q13547 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC1Q13547 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC1Q13547 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC1Q13547 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HDAC1Q13547 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC1Q13547 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC1Q13547 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC1Q13547 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HDAC1Q13547 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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