Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRQ13535 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRQ13535 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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