Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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