Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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