Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms