Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms