Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOS1Q07889 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms